Aktionen skedde vid halv nio på måndagsmorgonen och bakom den står spanska organisationen Proactiva Open Arms, som bedriver räddningsverksamhet i Medelhavet.
EU-parlamentets rödgröna grupp GUE/NGL stöttar officiellt aktionen.
– Vi kan inte acceptera att Europa och medlemsländer som Italien stänger sina hamnar. Anledningen till att frivilligorganisationerna finns på medelhavet vet ju alla. Medlemsländerna har dragit sig ur och vill inte skapa ett system för livräddning utan har istället tryckt tillbaka folk till Libyen och Turkiet, säger EU-parlamentarikern Malin Björk till Dagens ETC.
Tysk kapten hotad
Någon timme efter aktionen kom rapporter om att Carola Rackete, kapten på Sea Watch 3, flyttats till hemlig ort efter att ha utsatts för hot.
– Det har varit några allmänna hot mot Carola. Därför har vi flyttat henne till hemlig ort, säger en talesperson för organisationen Sea-Watch, till Reuters.
Carola Rackete greps i helgen efter att ha forcerat en polisbåtsblockad och kört till en hamn på ön Lampedusa i Italien. Sea Watch 3 hade då i över två veckor försökt få lägga till i Italien efter att ha räddat 53 migranter.
Släpptes ur husarrest
Hon släpptes ur sin husarrest igår efter beslut av Italienska domaren Alessandra Vella. Hon konstaterade att Carola Rackete bara gjort sin plikt enligt internationell rätt när hon förde de nödställda i hamn.
– Jag är positiv till att domstolen konstaterar att det inte fanns grund för husarrest. Det visar ju att domstolsväsendet agerar självständigt trots att Salvini (Italiens inrikesminister) vill något annat, säger Malin Björk.