Miljöpartiet var i partiets begynnelse starka EU-kritiker. Det skiljer ut miljöpartisterna från deras europeiska systerpartier, som ser europatanken som en naturlig motsats till nationalism och ibland förespråkar ett slags Europas förenta stater.

MP och partiets väljare har med åren blivit ett alltmer EU-vänliga. Men det finns fortfarande en konflikt mellan det svenska Miljöpartiet och de gröna européerna om hur nära samarbetet ska vara.